MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187083	GTC	2	6	58	63	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249369
2	NT_187083	CGA	2	6	76	81	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249369
3	NT_187083	CGC	2	6	82	87	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249369
4	NT_187083	TCT	2	6	101	106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249369
5	NT_187083	CGC	3	9	109	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249369
6	NT_187083	GCG	2	6	276	281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249369
7	NT_187083	GC	3	6	309	314	0 %	0 %	50 %	50 %	409249369
8	NT_187083	CGC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249369
9	NT_187083	GTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249369
10	NT_187083	CTG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249369
11	NT_187083	GTCG	2	8	560	567	0 %	25 %	50 %	25 %	409249369
12	NT_187083	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249369
13	NT_187083	GTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249369
14	NT_187083	GCGT	2	8	781	788	0 %	25 %	50 %	25 %	409249369
15	NT_187083	CTGG	2	8	792	799	0 %	25 %	50 %	25 %	409249369
16	NT_187083	TGA	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249369
17	NT_187083	TGA	3	9	946	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249369
18	NT_187083	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	409249369
19	NT_187083	CG	3	6	983	988	0 %	0 %	50 %	50 %	409249369
20	NT_187083	GC	4	8	1002	1009	0 %	0 %	50 %	50 %	409249369
21	NT_187083	CGTC	2	8	1041	1048	0 %	25 %	25 %	50 %	409249369
22	NT_187083	TTAA	2	8	1068	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	409249369
23	NT_187083	CCA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249369
24	NT_187083	GGT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249369
25	NT_187083	GC	3	6	1275	1280	0 %	0 %	50 %	50 %	409249369
26	NT_187083	GTC	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249369
27	NT_187083	AGCGAA	2	12	1317	1328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249369
28	NT_187083	GGTGGC	2	12	1329	1340	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249369
29	NT_187083	CGG	2	6	1349	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249369
30	NT_187083	GAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249369
31	NT_187083	GCG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249369
32	NT_187083	TAT	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249369
33	NT_187083	CCG	2	6	1542	1547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249369
34	NT_187083	CAA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187083	TCT	2	6	1617	1622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187083	AAT	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187083	A	7	7	1705	1711	100 %	0 %	0 %	0 %	409249370
38	NT_187083	CAG	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249370
39	NT_187083	CGC	2	6	1767	1772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249370
40	NT_187083	CT	3	6	1776	1781	0 %	50 %	0 %	50 %	409249370
41	NT_187083	AGC	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249370
42	NT_187083	AGG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249370
43	NT_187083	GCA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249370
44	NT_187083	CCA	2	6	2175	2180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249370
45	NT_187083	CCG	2	6	2275	2280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249370
46	NT_187083	GAC	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249370
47	NT_187083	TGAG	2	8	2320	2327	25 %	25 %	50 %	0 %	409249371
48	NT_187083	ATA	2	6	2351	2356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249371
49	NT_187083	CG	3	6	2373	2378	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
50	NT_187083	CAG	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249371
51	NT_187083	GCC	2	6	2493	2498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249371
52	NT_187083	CGCT	2	8	2516	2523	0 %	25 %	25 %	50 %	409249371
53	NT_187083	CCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249371
54	NT_187083	GC	3	6	2610	2615	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
55	NT_187083	CAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249371
56	NT_187083	CTG	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249371
57	NT_187083	GCGA	2	8	2913	2920	25 %	0 %	50 %	25 %	409249371
58	NT_187083	CG	3	6	2943	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
59	NT_187083	GC	3	6	2949	2954	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
60	NT_187083	ATG	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249371
61	NT_187083	GGCGGA	2	12	2985	2996	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	409249371
62	NT_187083	TTG	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249371
63	NT_187083	AGCGC	2	10	3050	3059	20 %	0 %	40 %	40 %	409249371
64	NT_187083	GC	3	6	3128	3133	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
65	NT_187083	GCC	2	6	3139	3144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249371
66	NT_187083	CG	4	8	3245	3252	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
67	NT_187083	GC	3	6	3347	3352	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
68	NT_187083	CG	4	8	3399	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	409249371
69	NT_187083	CCAA	2	8	3448	3455	50 %	0 %	0 %	50 %	409249371
70	NT_187083	TGA	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249371
71	NT_187083	TGC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249371
72	NT_187083	CCG	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249371
73	NT_187083	TAT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249371
74	NT_187083	CTGG	2	8	3618	3625	0 %	25 %	50 %	25 %	409249371
75	NT_187083	ATG	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187083	TGA	3	9	3722	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187083	GTT	2	6	3791	3796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187083	GTC	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187083	TCA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187083	ATC	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187083	TAT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187083	CTG	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249372
83	NT_187083	GC	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	409249372
84	NT_187083	CGT	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249372
85	NT_187083	TCGA	2	8	4083	4090	25 %	25 %	25 %	25 %	409249372
86	NT_187083	GC	3	6	4111	4116	0 %	0 %	50 %	50 %	409249372
87	NT_187083	GCG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249372
88	NT_187083	CCTG	2	8	4239	4246	0 %	25 %	25 %	50 %	409249372
89	NT_187083	GGTA	2	8	4260	4267	25 %	25 %	50 %	0 %	409249372
90	NT_187083	GCC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249372
91	NT_187083	TGA	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249372
92	NT_187083	GAA	3	9	4594	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249372
93	NT_187083	CAG	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249372
94	NT_187083	CGG	2	6	4634	4639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249372
95	NT_187083	ATC	2	6	4672	4677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249372
96	NT_187083	CCGTA	2	10	4888	4897	20 %	20 %	20 %	40 %	409249372
97	NT_187083	TACC	2	8	4977	4984	25 %	25 %	0 %	50 %	409249372
98	NT_187083	CGT	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249372
99	NT_187083	GCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249372
100	NT_187083	TCTGG	2	10	5095	5104	0 %	40 %	40 %	20 %	409249372
101	NT_187083	TGG	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249372
102	NT_187083	CAG	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249372
103	NT_187083	AT	3	6	5205	5210	50 %	50 %	0 %	0 %	409249372
104	NT_187083	T	7	7	5257	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187083	AAT	2	6	5284	5289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187083	CCCTA	2	10	5290	5299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NT_187083	AT	4	8	5361	5368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187083	TA	3	6	5393	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187083	TAT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187083	T	6	6	5422	5427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187083	AGC	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187083	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249373
113	NT_187083	ACC	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249373
114	NT_187083	GGC	2	6	5528	5533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249373
115	NT_187083	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249373
116	NT_187083	GTC	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249373
117	NT_187083	TGT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249373
118	NT_187083	ATA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249373
119	NT_187083	GAT	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249373
120	NT_187083	GCCT	2	8	5759	5766	0 %	25 %	25 %	50 %	409249373
121	NT_187083	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249373
122	NT_187083	GC	4	8	5835	5842	0 %	0 %	50 %	50 %	409249373
123	NT_187083	CCA	2	6	5895	5900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249373
124	NT_187083	GGC	2	6	5969	5974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249373
125	NT_187083	GCC	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249373
126	NT_187083	TGA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249373
127	NT_187083	CTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249373
128	NT_187083	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249373
129	NT_187083	GGC	2	6	6104	6109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249373
130	NT_187083	TGG	2	6	6153	6158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249373
131	NT_187083	TGT	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249373
132	NT_187083	TAA	2	6	6169	6174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249373
133	NT_187083	CG	3	6	6244	6249	0 %	0 %	50 %	50 %	409249373
134	NT_187083	GAT	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249373
135	NT_187083	ACACCG	2	12	6273	6284	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409249373
136	NT_187083	GCG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249373
137	NT_187083	A	6	6	6423	6428	100 %	0 %	0 %	0 %	409249373
138	NT_187083	TGCC	2	8	6432	6439	0 %	25 %	25 %	50 %	409249373
139	NT_187083	GC	3	6	6441	6446	0 %	0 %	50 %	50 %	409249373
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164	NT_187083	CTA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249374
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169	NT_187083	A	6	6	8385	8390	100 %	0 %	0 %	0 %	409249374
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171	NT_187083	CG	4	8	8422	8429	0 %	0 %	50 %	50 %	409249374
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173	NT_187083	TAC	2	6	8489	8494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249374
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233	NT_187083	AAT	2	6	10951	10956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NT_187083	CTC	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NT_187083	AAC	2	6	12201	12206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249377
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258	NT_187083	CAG	3	9	12653	12661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NT_187083	CGG	2	6	12721	12726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249378
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264	NT_187083	T	6	6	12971	12976	0 %	100 %	0 %	0 %	409249379
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291	NT_187083	AAT	2	6	14183	14188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NT_187083	T	6	6	18621	18626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NT_187083	CAA	2	6	18709	18714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NT_187083	TTA	2	6	18731	18736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NT_187083	ATAA	2	8	18759	18766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NT_187083	GCG	2	6	18974	18979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249384
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394	NT_187083	TCT	2	6	19052	19057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
395	NT_187083	AGC	2	6	19067	19072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249384
396	NT_187083	CGA	2	6	19120	19125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249384
397	NT_187083	CGC	2	6	19173	19178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249384
398	NT_187083	CGCTAA	2	12	19180	19191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409249384
399	NT_187083	ACCA	2	8	19224	19231	50 %	0 %	0 %	50 %	409249384
400	NT_187083	CACG	2	8	19263	19270	25 %	0 %	25 %	50 %	409249384
401	NT_187083	CTT	2	6	19290	19295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
402	NT_187083	TCT	2	6	19325	19330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
403	NT_187083	TTG	3	9	19388	19396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249384
404	NT_187083	GCCA	2	8	19397	19404	25 %	0 %	25 %	50 %	409249384
405	NT_187083	ATA	2	6	19445	19450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249384
406	NT_187083	CTT	2	6	19494	19499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
407	NT_187083	CAG	2	6	19506	19511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249384
408	NT_187083	TTC	3	9	19537	19545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
409	NT_187083	CTT	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249384
410	NT_187083	CAT	2	6	19671	19676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249384
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413	NT_187083	ACG	2	6	19820	19825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249384
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419	NT_187083	CAAG	2	8	20235	20242	50 %	0 %	25 %	25 %	409249384
420	NT_187083	TCAG	2	8	20264	20271	25 %	25 %	25 %	25 %	409249384
421	NT_187083	CCAG	2	8	20328	20335	25 %	0 %	25 %	50 %	409249384
422	NT_187083	A	6	6	20344	20349	100 %	0 %	0 %	0 %	409249384
423	NT_187083	GTTG	2	8	20353	20360	0 %	50 %	50 %	0 %	409249384
424	NT_187083	T	6	6	20404	20409	0 %	100 %	0 %	0 %	409249384
425	NT_187083	AGG	2	6	20496	20501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249384
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427	NT_187083	CGG	2	6	20677	20682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NT_187083	GCG	2	6	20865	20870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249385
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475	NT_187083	T	6	6	22755	22760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NT_187083	GAGTT	2	10	22763	22772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
477	NT_187083	CG	3	6	22801	22806	0 %	0 %	50 %	50 %	409249387
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